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ゲノム解析実務初級編

検定作成者: けいゲノム解析に使うソフトやコマンドについての検定

1問目: fastqデータの前処理で使われないソフトは？

2問目: ロングリード(ONT)のデータの前処理に使うソフトはどれ？

3問目: bamファイルから遺伝子ごとの発現量を算出するソフトは？

4問目: 参考文献が無く、製作者のgithubページを引用する必要があるソフトは？

5問目: RNAseqの発現比較で、R環境で統計解析や可視化を行うソフトはどれか

6問目: リードカウントの正規化に用いられる手法はどれか

7問目: bwa(BWA-0.7.18 (r1243))のコマンドのうち、参照配列に配列をアラインする際のコマンドはどれ？

8問目: ロングリードをアセンブルに使えないソフトはどれ？

9問目: GATKを使ってSNPやindelをコールするときのサブコマンドはどれ？

10問目: scRNAseq解析において一般的に使われないソフトは？

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